Prodi S2 magister budidaya perairan adalah salah satu program studi yang ada di FPIK UB. Jumlah dosen yang mengampu sekaligus membimbing mahasiswa prodi S2 Magister budidaya adalah sebanyak 42 dosen dengan rincian 14 guru besar dan 28 Doktor. Fokus keilmuan program magister Budidaya perairan beragam karena masing-masing dosen memiliki bidang keahlian masing2 dan memiliki grup riset yang bekerja sesuai dengan bidang keahlian tertentu dan melibatkan mahasiswa sebagai asisten riset. Wilayah kerja penelitian dan pengabdian dosen magister budidaya perairan meliputi wilayah perairan laut, tawar dan payau. Masing masing dosen bekerja pada bidang dan wilayah tersebut, tidak terkecuali mahasiswa. Semua bidang tersebut masih dalam koridor keunggulan prodi S2 magister budidaya perairan yaitu Sustainable aquaculture dengan 4 pilar keahlian nutrisi, penyakit, produksi dan lingkungan budidaya.